Un visualisateur de molécules très pratique et gratuit

Enseignants de sciences physiques et de sciences de la vie et de la terre, vous connaissez sans doute Rasmol, visualisateur de molécules en 3D.

Jmol est un utilitaire du même genre qui a le vent en poupe. Il fonctionne sous Windows, Mac et Linux.

Un des avantages que les enseignants de sciences physiques lui trouveront sans doute, est sa capacité à afficher des doubles et triples liaisons covalentes, et même... de les créer sur des modèles de molécules qui en étaient dépourvus !

La vidéo suivante (à afficher en plein écran) vous montrera comment installer et utiliser Jmol, et aussi comment ajouter des doubles liaisons sur une molécule existante.

Commentaires

Bonjour,

Il existe un programme libre de droit pour visualiser les molécules en 3D très puissant. Qui d'ailleurs avec votre exemple éthylène, ouvre directement le ficher pdb avec la double liaison.
Avogadro:
http://avogadro.openmolecules.net/wiki/Main_Page

Il permet en plus de gérer la vraie géométrie des molécules quelque soit la façon dont vous la dessinez. Il gère aussi les interactions entre les molécules. Par exemple si on met beaucoup de molécules d'eau, en optimisant la géométrie, on les voit se tourner afin de créer des liaisons hydrogènes.

La version disponible est la 1.0.1, mais si vous arrivez à la trouver préférez la 1.0.0 qui est en français. Il y a apparemment un bug pour la langue dans la 1.0.1

Super votre blog

Nicolas MORIN
Enseignant Sciences Physiques

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