Des modèles moléculaires virtuels, avec le logiciel Avogadro [MàJ]

Mise à jour 24 avril 2012 : la dernière version du logiciel est en français


Un modèle en plastique, créé à partir d'une boite de modèles moléculaires

Hier, je vous présentais le logiciel Jmol, permettant d'afficher des modèles moléculaires en 3D. Suite à cet article, mon collègue Nicolas Morin nous a communiqué l'existence d'un logiciel proche, libre et gratuit, permettant de créer des molécules très facilement.

Il s'agit d'Avogadro, que vous pouvez trouver ici (cliquer sur GET AVOGADRO).


Le modèle virtuel de la molécule ci-dessus, créé avec le logiciel Avogadro

Les enseignants de sciences physiques qui cherchaient une boite de modèles moléculaires virtuelle, seront servis !

Voici une courte présentation du logiciel en vidéo (à afficher en plein écran) :

Commentaires

J'ai suivi avec plaisir et profit votre vidéo sur le logiciel Avogadro.
> Pouvez-vous m'indiquer s'il est possible de télécharger d'autres molécules ou si il y a un moyen d'utiliser celles du chemical-structure. Merci.

Homeyer : j'ai trouvé ce site http://www.molecularmodels.ca/programmes/modsrch.htm qui permet de récupérer plein de molécules pour une utilisation en classe.

A noter que l'on peut changer la couleur du fond pour pouvoir utiliser la couleur noir pour les atomes de carbone et non pas Gris.

Bonjour,

Savez vous si on peut obtenir le nom de la molécule ou sa formule brute une fois fabriquée ? Merci

Ezin : pas que je sache :-(

Merci pour cet article, et pour tout le site en général :D
Un merveilleux outil que je vais tester très prochainement en classe.

okay on voit comment les profs font leur cours

Avogadron est trés interessant pour fabriquer et faire comprendre la structure des molécules, en particulier les conformères. mais j'ai un problème avec Window XP. J'ai fabriqué des modèles moléculaires, je les ai enregistrés, je pouvais retrouver ces modèles par un double clic sur l'icône correspondante, mais 2 jours aprés, l'icône a changé sans intervation de ma part et je ne peux plus rien ouvrir. Que puis-je faire?

Sylvette : essayez un bouton droit / ouvrir avec, puis choisissez Avogadro. Ou au pire, ouvrez Avogadro et ouvrez le fichier depuis le logiciel en cliquant sur Fichier / ouvrir.

Merci à F.Gély. Avec le bouton droit et Avogadro , impossible. Je voudrais bien savoir pourquoi. Mais cela marche en faisant glisser le fichier sur Avogadro ouvert.

Bonjour.
J'ai réussi à changer la couleur du fond.
Mais, comment changer la couleur des atomes ? (pour rendre les atomes d'hydrogène plus blancs et les atomes de carbone plus noirs).
Merci

Fred : apparemment, une personnalisation des couleurs sera possible dans la prochaine version 1.1 du logiciel. Cf. http://avogadro.openmolecules.net/wiki/To_Do_for_1.1 : "Element settings dialog: setup custom colors/sizes/labels for atoms of different elements (done)"

Merci F. Gély pour la réponse.
J'ai hâte.
Bonne journée

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